ESTUDIOS DE ACOPLAMIENTO MOLECULAR DE DERIVADOS DE FENILAMINOPIRIMIDINA COMO POSIBLES INHIBIDORES DE LA PROTEASA PRINCIPAL DEL SARS-CoV-2

Abel Suárez-Castro

Resumen


Resumen

Se presentan los resultados de estudios de acoplamiento molecular de un conjunto de 18 fenilaminopirimidinas (PAP) 5a – r contra la principal proteasa del SARS-CoV-2.  Además, estos compuestos han sido reportados previamente por nuestro grupo de investigación. Las mejores interacciones de tipo ligando-receptor se obtuvieron en los compuestos 10i, 10m y 10o como se muestra por la predicción de su energía libre o de Gibbs de: −9.83, −9.71 y −9.02 kcal/mol respectivamente. Además, es necesario resaltar que, estas energías predichas, son mejores en comparación con la energía libre del ligando co-cristalizado en el receptor (-7.78 kcal/mol). Estos resultados proporcionan una base sólida para probar los compuestos PAP en estudios in vitro con el fin de explorar la posible inhibición de la proteasa principal del SARS-CoV-2.

Palabras clave: fenilaminopirimidinas; acoplamiento molecular; proteasa principal; SARS-CoV-2.

Abstract

A set of 18 imine-phenylaminopyrimidines (imine-PAP) 5a–r against the main protease of SARS-CoV-2, is presented. In addition, these compounds have been previously reported by our group. The best receptor-ligand interactions were obtained from 10i, 10m and 10oas shown by their predicted free Gibbs −9.83, −9.71 and −9.02 kcal/mol respectively. This is in comparison with the cocrystalized ligand in the main protease (−7.78 kcal/mol,). These results provide solid foundation in order to test the imine-PAP compounds in in vitro studies in order to explore the possible inhibition of the main protease of SARS-CoV-2.

 

Keywords: phenylaminopyrimidines; molecular docking; main protease; SARS-CoV-2.

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